Nakon zločina u Stupnom Dolu kod Vareša, gdje su pripadnici specijalnih jedinica HVO-a, prema prvostepenoj presudi ubili 36 civila, silovali tri žene, opljačkali i zapalili selo, čelnici HVO-a tvrdili su da provode istragu o tom zločinu.
Međutim, Haški sud je utvrdio da ta istraga nikada nije provedena i da je za to odgovorno rukovodstvo HVO-a i samoproglašene Hrvatske Republike Herceg-Bosna.